Précisément
Gimp à mon sens est un logiciel de création / manipulation d'images, pas un logiciel de PAO. À trop vouloir en faire avec un seul outil, on se retrouve avec des usines à gaz qui font tout mal.
Finalement le besoin que vous exprimez est celui d'un front-end graphique à des outils tels que pdftk (ou aux bibliothèques sous-jacentes.)
Il y en a probablement même déjà un.
Bonne fin de journée