a grandes rasgos, dd es exactamente esto, hace una copia bloque a bloque, sin importar permisos ni nada, es a bajo, muy bajo nivel, para que sirve esto? digamos que tienes que copiar un disco o una particion entera, con dd lo puedes hacer fielmente y de una manera realmente rapida, lo uso mucho para clonar maquinas virtuales con kvm, pero su uso la verdad es muy versatil, tambien lo puedes emplear para extraer una iso de un cd y volcarlo en otro, para generar archivos vacios del tamaño que quieras. la gran diferencia es esa, al hacer una copia bloque a bloque, no importa el estado actual de un archivo, ni los permisos, ni nada, es rapido, limpio y aplicable en muchos casos.
aqui esta sencilla (pero util) explicacion de dd
saludos.