Здравствуйте,
Скрипт nfs, с которого разговор начался, сам устанавливается с нужным номером,
а простым юзерам лезть в настройки файрволла совершенно незачем. И заниматься
написанием системных скриптов им тоже незачем. У них и права не должно
быть такого. А те пользователи, которые знают, для чего предназначен нестандартный
сервис и как он взаимодействует со всеми остальными, обычно понимают, какой
номер им поставить, и соответствующие права у них имеются. Остальным, которые
не могут набрать и прочитать man update-rc.d, нечего делать в /etc/rcX.d.