[LCFC] wml://devel/debian-med/microbio.wml
Le Thu, Jul 26, 2007 at 10:13:57PM +0200, Cyril Brulebois a écrit :
> Charles Plessy <charles-debian-nospam@plessy.org> (26/07/2007):
> > Merci d'avance pour vos relectures !
>
> Hop, trois petites choses.
Merci beaucoup.
Comme c'est juste trois petites choses, je passe au LCFC.
Bonne journée,
-- Charles
>
> --
> Cyril
> --- microbio.wml.patch.orig 2007-07-26 22:12:40.000000000 +0200
> +++ microbio.wml.patch 2007-07-26 22:13:19.000000000 +0200
> @@ -107,7 +107,7 @@
> + fonctions similaires, comme BLAST (du NCBI) ou Fasta (par Bill Pearson).
> + D'autres encore, comme le paquet HMMER (Sean Eddy), ou le paquet SAM
> + (Université de Californie Santa Cruz) se concentrent sur la modélisation des
> -+ biopolymères par des automates de Markov à états cachés ( abrégé <q>HMM</q>
> ++ biopolymères par des automates de Markov à états cachés (abrégé <q>HMM</q>
> + en anglais).
> +
> + Le point fort de Wise2 est la comparaison de séquences d'ADN en tenant compte
> @@ -125,7 +125,7 @@
> +
> + Wise2 a été écrit de manière à être réutilisable et maintenable. Bien qu'il
> + sont écrit en pur langage C, on peut accéder à ses fonctionnalités via Perl.
> -+ Des parties de ce paquet, voire le paquet entier, peuvent être utilisés par
> ++ Des parties de ce paquet, voire le paquet entier, peuvent être utilisées par
> + d'autres programmes en C ou en C++ sans risquer des collisions de noms de
> + variables car chaque variable exportée est préfixée par un identifiant Wise2
> + unique. L'ouverture vers Java et CORBA est en cours de considération, voir
> @@ -205,7 +205,7 @@
> + séquences ont été réimplémentées en C pour une plus grande efficacité.
> + Exonerate est un des composants utilisés pour la construction des banques de
> + données génomiques ENSEMBL, en calculant des scores de similarité entre des
> -+ séquences d'ADN et d'ARN, déterminant par la-même les variants d'épissage et
> ++ séquences d'ADN et d'ARN, déterminant par là-même les variants d'épissage et
> + les séquences codantes en général.
> </project>
>
--
Charles Plessy
http://charles.plessy.org
Wako, Saitama, Japan
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