Charles Plessy <charles-debian-nospam@plessy.org> (26/07/2007): > Merci d'avance pour vos relectures ! Hop, trois petites choses. -- Cyril
--- microbio.wml.patch.orig 2007-07-26 22:12:40.000000000 +0200 +++ microbio.wml.patch 2007-07-26 22:13:19.000000000 +0200 @@ -107,7 +107,7 @@ + fonctions similaires, comme BLAST (du NCBI) ou Fasta (par Bill Pearson). + D'autres encore, comme le paquet HMMER (Sean Eddy), ou le paquet SAM + (Université de Californie Santa Cruz) se concentrent sur la modélisation des -+ biopolymères par des automates de Markov à états cachés ( abrégé <q>HMM</q> ++ biopolymères par des automates de Markov à états cachés (abrégé <q>HMM</q> + en anglais). + + Le point fort de Wise2 est la comparaison de séquences d'ADN en tenant compte @@ -125,7 +125,7 @@ + + Wise2 a été écrit de manière à être réutilisable et maintenable. Bien qu'il + sont écrit en pur langage C, on peut accéder à ses fonctionnalités via Perl. -+ Des parties de ce paquet, voire le paquet entier, peuvent être utilisés par ++ Des parties de ce paquet, voire le paquet entier, peuvent être utilisées par + d'autres programmes en C ou en C++ sans risquer des collisions de noms de + variables car chaque variable exportée est préfixée par un identifiant Wise2 + unique. L'ouverture vers Java et CORBA est en cours de considération, voir @@ -205,7 +205,7 @@ + séquences ont été réimplémentées en C pour une plus grande efficacité. + Exonerate est un des composants utilisés pour la construction des banques de + données génomiques ENSEMBL, en calculant des scores de similarité entre des -+ séquences d'ADN et d'ARN, déterminant par la-même les variants d'épissage et ++ séquences d'ADN et d'ARN, déterminant par là-même les variants d'épissage et + les séquences codantes en général. </project>
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