Pues... ahondando un poco a lo que dice Cristian, igualmente creo que
la respuesta a tu pregunta tiene que ver directamente con qué es lo
que queires virtualizar, ¿todo un sistema operativo con muchas
aplicaciones o solamente un par de servicios? KVM es genial para
virtualizar un sistema completo y para producción. Docker por su parte
es muy socorrido para que puedas aislar y reproducir un ambiente de
desarrollo encapsulado donde tengas ciertas versiones de software y
bibliotecas sin que entren en conflicto con tu sistema operativo.
Espero que esto ayude a aclarar el panorama.
Saludos