A ver, acerca de lo de los modulos, es facil, tienes que actualizar el paquete module-init-tools, para que reconosca el estilo de los modulos del kernel 2.6 (creo que el paquete actualizado solo esta en sid). En cuanto a lo del KDE, ¿a que distrubucion te actualizaste? Si fue a sid, pues vas a tener que esperar unos dias, ya que a veces suceden esas cosas (todo se corrompe por culpa de un paquete y hay que esperar a que lo reparen).