Quando vc loga no KDE, eh executado um shell de login, ou não-interativo. Nesse momento, o GDM (ou KDE?) procura por um arquivo de perfil para ler (.profile ou .bash_profile -- este último tem precedência sobre o .profile).
Ou seja, provavelmente vc quer utilizar o arquivo .bash_profile, se o shell padrão é o bash.