Re: Installation von EMBOSS
Am Samstag, den 22.07.2006, 14:34 +0200 schrieb Daniel Leidert:
> Am Samstag, den 22.07.2006, 14:04 +0200 schrieb Bernhard Kleine:
>
> > ich versuche die EMBOSS-Pakete für Molekularbiologie zu installieren und
> > benötige Hilfe:
> >
> > z.B. wundere ich mich, dass die libpng nicht in debian existiert
>
> Das stimmt nicht: '$ dpkg -l "libpng*"' beweist das Gegenteil. Du willst
> wahrscheinlich einfach nur ein:
>
> $ apt-get|aptitude install libpng12-dev
>
> > bzw. dass beim Kompilieren ein Fehler auftaucht,
>
> Solange du nicht sagst, welcher Fehler auftaucht, ist deine Aussage,
> dass du dich darüber "wunderst", eher wunderlich.
>
Ich weiß, aber ich habe einen Versuch gemacht, dabei habe ich gesehen,
dass die Zeile, in der nach einem Eintrag in der Libpng gesucht wurde,
mit "no" beantwortet wurde.
Mit den headern, da hätte ich selbst drauf kommen sollen, aber in der
Emboss-administration-Anleitung stand definitiv nichts von Headern drin.
Allerdings ist diese Anleitung auch schon etwas älter, immerhin ist
emboss heute bei Version 4.etwas und in der Anleitung bei 2.etwas.
> [..]
> > Außerdem würde ich gerne eine graphische Oberfläche benutzen. Hat jemand
> > damit Erfahrung?
>
> Ich denke, bei Problemen mit EMBOSS, solltest du dich zusätzlich an die
> debian-science- und/oder debian-med-Liste wenden (in letzterer solltest
> du Steffen Möller und Andreas Tille finden, die Mitglied im
> pkg-emboss-Projekt sind).
Die pkg-emboss-Seite auf Sourceforge ist völlig tot! Und vom dem Paket
gibt es nichts zu sehen.
Da es aber ein Free-BSD-Paket gibt, meine Frage, wäre das nicht eine
Grundlage, auch ein Debian-Paket zu erstellen? Gibt es für die
Konversion BSD->Debian ähnliche Tools wie alien für RPM->DEB?
> Weitere Informationen zu EMBOSS und Debian:
> http://wiki.debian.org/?action=fullsearch&value=emboss&fullsearch=Text,
> http://www.debian.org/devel/debian-med/microbio.de.html.
>
> MfG Daniel
>
>
Danke für Deine Antwort, ich werde es nochmals probieren.
Bernhard
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