premetto che quello che scrivo è relativo a init, se stai usando systemd, allora non so se quanto scrivo è ancora valido... non ho ancora indagato in merito
E' possibile che con qualche ultimo aggiornamento sia cambiato il metodo di avvio di apache2 passando a systemd
$ man update-rc.d
# update-rc.d apache2 disable
Il risultato dovrebbe essere analogo a cio' che ho fatto rinominando il file in /etc/rc2.d ma faro' una prova.
per vedere l'init di default $ grep initdefault /etc/inittab id:2:initdefault:
Gia controllato init di default e' il 2 :-(