Por si a alguien le interesa he realizado un pequeño manual de cómo instalar Apache con SSL, PHP y MySQL con apache dentro de una jaula usando mod_chroot. http://resete.sytes.net/blog/index.php/2007/03/06/apache-en-chroot-con-mod_chroot/ Aún me queda solucionar alguna cosilla como poder ejecutar algún binario con la función exec() de PHP.