Una facil del /etc/init.d/

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Hola, 

para iniciar una aplicación o script al arranque siempre lo pongo en
el directorio de /etc/init.d y lo "activo" por el webmin para que
carge, quiero ahora saber como lo ago sin el webmin es decir que
archivo debo editar y como hacer para que esta aplicación se ejecute
cuando se loguee un usuario especifico.

salu2
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