Estabilidade é ext3.Ext4 se tu tiver certeza que não vai ter nenhum problema com compatibilidade (sistemas legados ou transferência de arquivo para sistemas NT).
Se não tem nenhum Windows na tua máquina ou outros sistemas sem suporte a extents e journaling, ou se tu for instalar só um Linux no disco então é ext4.
Em qualquer outro cenário estabilidade só com ext3. Em todo caso tu pode usar ext3 ou até ext2 na partição /boot.