Развитие событий... Я попробовал зажать скорость SATA на полтора гига (как было на прежней материнке), но это не помогло. Стал бекапить некие данные на второй диск (mc, там видно скорость процесса) - и в какой-то момент процесс стал рывками замедляться. Тыр-тыр читает медленно - и потом снова быстро. Когда медленноЮ, слышен ритмичный шум HDD.
Такое впечатление, что когда происходит эта проблема в ядре тормозит вся дисковая подсистема вообще. Тормозило всё что обращалось к диску.Но! В SMART всё по-прежнему чисто, хотя теперь уже (до этого бекапа) я и в BIOS его включил. Ошибок в логе нет. raw read error rate по нулям (правда, на втором 1), reallocated sector count - тоже по нулям.