[RFR] wml://devel/debian-med/microbio.wml
Bonjour à tous,
voici une nouvelle rustine pour la page microbio.wml, dont le numéro de
version a été encore incrémenté sur la page originale. Les changements
sont des transformation de guillemets en balises <q></q>.
Les autres changements ont été relus auparavant, mais pas encore
propagés.
http://lists.debian.org/debian-l10n-french/2007/01/threads.html#00279
--
Charles Plessy
http://charles.plessy.org
Wako, Saitama, Japan
? microbio.wml.rustine
Index: microbio.wml
===================================================================
RCS file: /cvs/webwml/webwml/french/devel/debian-med/microbio.wml,v
retrieving revision 1.12
diff -u -r1.12 microbio.wml
--- microbio.wml 20 Aug 2006 15:07:01 -0000 1.12
+++ microbio.wml 24 Jan 2007 00:20:38 -0000
@@ -1,6 +1,6 @@
<define-tag pagetitle>Debian-Med : Biologie moléculaire et génétique</define-tag>
-#use wml::debian::translation-check translation="1.64" maintainer="Charles Plessy"
+#use wml::debian::translation-check translation="1.67" maintainer="Charles Plessy"
#use wml::debian::debian-cdd CDD="Debian-Med"
#$Id: microbio.wml,v 1.12 2006/08/20 15:07:01 thuriaux Exp $
@@ -75,7 +75,7 @@
license="<free />"
deb="http://packages.debian.org/unstable/science/blast2";>
Le célèbre programme d'alignement de séquences. Ceci est la version
- « officielle » numéro 2 du NCBI. Le programme
+ <q>officielle</q> numéro 2 du NCBI. Le programme
blastall accepte en entrée une séquence nucléotidique ou protéique,
la compare au contenu de banques de données, et renvoie à l'utilisateur
un résumé des appariements.
@@ -153,7 +153,7 @@
devraient consulter la documentation de DNAML avant d'utiliser ce programme.
FastDNAml est une tentative de résoudre le même problème que DNAML, mais plus
vite et en utilisant moins de mémoire, de manière à ce que des grands arbres
- et/ou un grand nombre de répliquas « bootstrap » soient possibles. La
+ et/ou un grand nombre de répliquas <q>bootstrap</q> soient possibles. La
principale modification de fastDNAml par rapport à DNAML 3.3 de PHYLIP est
d'avoir été porté de PASCAL au C.
</project>
@@ -287,7 +287,7 @@
</p>
<p>
À partir d'un alignement multiple de séquences, HMMER construit un modèle
- statistique appelé « modèle de Markov caché », qui peut ensuite
+ statistique appelé <q>modèle de Markov caché</q>, qui peut ensuite
être utilisé pour interroger une banque de séquences afin de trouver plus
d'homologues à la famille de séquences, et éventuellement les aligner.
</p>
@@ -321,8 +321,8 @@
quantitatifs, mais cette restriction sera levée dans une version future.
L'estimation combinée du nombre de QTLs (<i>Quantitative Trait Loci</i>), de leur
position et de leurs effets est faite par un saut réversible MCMC (RJMCMC).
- Il est aussi possible de faire des analyses de type « affected only IBD
- sharing ».
+ Il est aussi possible de faire des analyses de type <q>affected only IBD
+ sharing</q>.
</project>
@@ -362,8 +362,8 @@
license="Public Domain"
deb="http://packages.debian.org/unstable/science/muscle";>
MUSCLE est un programme pour l'alignement multiple de séquences protéiques.
- MUSCLE est un acronyme anglais signifiant « comparaison de séquences
- multiples par log-expectation ». Dans des tests mesurant la qualité des
+ MUSCLE est un acronyme anglais signifiant <q>comparaison de séquences
+ multiples par log-expectation</q>. Dans des tests mesurant la qualité des
alignements et effectués par ses auteurs, MUSCLE a obtenu les meilleurs notes
parmi tous les programmes comparés. C'est aussi l'un des plus rapides.
</project>
@@ -384,7 +384,7 @@
<project name="PerlPrimer"
url="http://perlprimer.sourceforge.net/";
license="GPL"
- deb="http://bioinformatics.pzr.uni-rostock.de/~moeller/debian/perlprimer/";>
+ deb="http://packages.debian.org/unstable/science/perlprimer/";>
PerlPrimer est une application graphique libre écrite en Perl pour
choisir des amorces pour des PCR standard, à bisulfite, en temps réel
et pour le séquençage. Son but est d'automatiser et de simplifier
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python. Il a été développé pour la visualisation en temps réel et la
génération rapide d'images et d'animations de haute qualité. Il est
modifiable et disponible librement pour tous, sous licence
- « python ». Bien que relativement récent, PyMOL peut
+ <q>python</q>. Bien que relativement récent, PyMOL peut
être utilisé pour produire des images ahurissantes avec une facilité jamais
atteinte auparavant. Il peut aussi effectuer d'autres tâches utiles, comme
éditer un fichier au format PDB, pour vous aider dans vos recherches.
@@ -517,6 +517,22 @@
améliorer l'alignement localement.
</project>
+<project name="SIBsim4"
+ url="http://sibsim4.sourceforge.net/";
+ license="<free />"
+ deb="http://packages.debian.org/unstable/science/sibsim4";>
+ Le projet <acronym lang="en" title="Swiss Institute of
+ Bioinformatics">SIB</acronym>sim4 est basé sur sim4, un programme pour aligner
+ une séquence d'<acronym lang="fr" title="Acide DésoxyriboNucléique
+ complémentaire">ADNc</acronym> sur une séquence génomique, en tenant compte de
+ l'existance d'introns. Sim4 a été écrit par Liliana Florea lorsqu'elle
+ travaillait dans le laboratoire de Webb Miller dans l'université de
+ Pennsylvanie. Dans SIBsim4, le code source original a été fortement remanié
+ avec comme buts : l'amélioration de la vitesse ; l'utilisation de
+ séquences d'ADN de l'ordre de grandeur d'un chromosome ; une meilleure
+ description des variants d'épissage et des sites de polyadénylation.
+</project>
+
<project name="T-Coffee"
url="http://igs-server.cnrs-mrs.fr/~cnotred/Projects_home_page/t_coffee_home_page.html";
@@ -537,7 +553,7 @@
deux nouveaux environnements :
<ul>
<li>
- L'environnement « textopo » est utilisé pour
+ L'environnement <q>textopo</q> est utilisé pour
représenter les données sur la topologie des protéines membranaires
dérivées de prédictions PHD, de la base de données SwissProt, ou de données
entrées manuellement, contenant l'information sur la séquence et les
@@ -545,7 +561,7 @@
</li>
<li>
- L'environnement « helical wheel » dessine des
+ L'environnement <q>helical wheel</q> dessine des
domaines transmembranaires vus d'un côté ou de l'autre de la membrane
cellulaire.
</li>
@@ -558,14 +574,14 @@
license="GPL"
deb="http://packages.debian.org/unstable/science/tree-puzzle";>
TREE-PUZZLE (le nouveau nom de PUZZLE) est une console interactive qui
- implémente un algorithme rapide de recherche d'arbre, le « quartet
- puzzling », qui permet l'analyse de données volumineuses et qui
+ implémente un algorithme rapide de recherche d'arbre, le <q>quartet
+ puzzling</q>, qui permet l'analyse de données volumineuses et qui
assigne à chaque branche un estimateur de confiance. TREE-PUZZLE calcule
aussi des distances paire à paire par vraisemblance maximale, ainsi que la
taille des branches pour des arbres spécifiés par l'utilisateur. La taille
des branches peut aussi être calculée sous l'hypothèse de l'horloge
moléculaire. De plus, TREE-PUZZLE propose une nouvelle méthode, le
- « likelihood mapping », pour tester la valeur d'une
+ <q>likelihood mapping</q>, pour tester la valeur d'une
branche interne sans calculer un arbre entier et pour visualiser le contenu
phylogénétique d'un alignement de séquences.
</project>
@@ -677,9 +693,9 @@
deb="http://debian.bioinformatics.unsw.edu.au/packages/";>
<p>
- <a href="http://www.emboss.org/";>EMBOSS</a> (« <em>E</em>uropean
+ <a href="http://www.emboss.org/";>EMBOSS</a> (<q><em>E</em>uropean
<em>M</em>olecular <em>B</em>iology <em>O</em>pen <em>S</em>oftware
- <em>S</em>uite ») est un nouvel ensemble de logiciels libres pour l'analyse
+ <em>S</em>uite</q>) est un nouvel ensemble de logiciels libres pour l'analyse
de séquences spécialement écrits pour les besoins des biologistes moléculaires
(comme chez <a href="http://www.embnet.org/";>EMBnet</a>). Les logiciels
se débrouillent avec des données dans divers formats et permettent même de
@@ -786,7 +802,7 @@
</p>
<p>
La spécificité de SMILE est de permettre de manipuler ce que l'on
- appelle des « motifs structurés », qui sont des
+ appelle des <q>motifs structurés</q>, qui sont des
motifs associés par des contraintes de distance.
</p>
</project>
@@ -845,7 +861,7 @@
progrès développés par la communauté académique, comme la boîte à outils
Globus Metacomputing, le système d'entrée-sortie parallèle de fichiers
HDF5, la bibliothèque PETSc, le démêlage adaptatif d'enchevêtrements
- (« adaptive mesh refinement »), des interfaces web
+ (<q>adaptive mesh refinement</q>), des interfaces web
et des outils avancés pour la visualisation.
</p>
</project>
@@ -893,7 +909,7 @@
<project name="POA"
url="http://sourceforge.net/projects/poamsa/";
license="GPL">
- POA signifie Alignement d'Ordre Partiel (« Partial Order Aligment »
+ POA signifie Alignement d'Ordre Partiel (<q>Partial Order Aligment</q>
en anglais). C'est un programme rapide d'alignement multiple de séquences. Ses
points forts sont la vitesse, la déployabilité, la sensibilité et son
aptitude supérieure à gérer les branchements et les indels dans l'alignement.
@@ -913,8 +929,8 @@
<project name="Sigma"
url="http://www.imsc.res.in/~rsidd/sigma/";
license="GPL">
- Sigma (simple alignement multiple glouton, « SImple Greedy Multiple
- Alignment » en anglais), est un programme contenant un nouvel algorithme
+ Sigma (simple alignement multiple glouton, <q>SImple Greedy Multiple
+ Alignment</q> en anglais), est un programme contenant un nouvel algorithme
et un nouveau système d'évaluation conçu tout particulièrement pour les
séquences non-codantes. Sigma utilise comme stratégie la recherche du
meilleur alignement local possible sans indel (stratégie utilisée auparavant
@@ -938,5 +954,5 @@
TM-align est un programme d'alignement structural qui compare deux protéines
de séquences différentes. TM-align va d'abord rechercher les résidus les plus
équivalents dans les deux protéines, d'après la similarité de leurs
- structures, puis ensuite produit un score « TM ».
+ structures, puis ensuite produit un score <q>TM</q>.
</project>
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