[RFR] wml://devel/debian-med/microbio.wml
Bonjour à tous,
Trois petites modifications dans la page biologie moléculaire du projet
debian-med (c'est moi qui les ai proposées en anglais, je dois être
maso ;)
Je joins le diff français en fichier attaché et le diff anglais dans le
corps du message.
C'est du jargon assez hermétique, n'hésitez pas à critiquer si ça
ressemble trop à du n'importe quoi.
J'ai profité de l'occasion pour remplacer « visualisateur » par
« visionneuse », le premier me semblant un peu barbare. J'hésite à
transformer tous les « visualiser » par « visionner », ou alors
seulement quand le programme ne possède pas de fonctions d'édition
avancées. Qu'en pensez-vous ?
--
Charles
> revision 1.59
> date: 2006/04/10 14:52:53; author: toddy; state: Exp; lines: +36 -11
> Added new projects: Muscle, Dialign. Moved Treeview into unofficial
> section
> =============================================================================
> Index: english/devel/debian-med/microbio.wml
> ===================================================================
> RCS file: /cvs/webwml/webwml/english/devel/debian-med/microbio.wml,v
> retrieving revision 1.58
> retrieving revision 1.59
> diff -u -r1.58 -r1.59
> --- english/devel/debian-med/microbio.wml 27 Mar 2006 20:49:22 -0000 1.58
> +++ english/devel/debian-med/microbio.wml 10 Apr 2006 14:52:53 -0000 1.59
> @@ -1,7 +1,7 @@
> <define-tag pagetitle>Debian-Med: Molecular Biology and Medical Genetics</define-tag>
> # Note to the translators: Please do *not* translate the following line.
> #use wml::debian::debian-cdd CDD="Debian-Med"
> -# $Id: microbio.wml,v 1.58 2006/03/27 20:49:22 toddy Exp $
> +# $Id: microbio.wml,v 1.59 2006/04/10 14:52:53 toddy Exp $
>
> ######################################################################
> ## Available as an official Debian package
> @@ -266,6 +266,18 @@
> </project>
>
>
> +<project name="Muscle"
> + url="http://www.drive5.com/muscle/";
> + license="Public Domain"
> + deb="http://packages.debian.org/unstable/science/muscle";>
> + MUSCLE is a multiple alignment program for protein sequences. MUSCLE
> + stands for multiple sequence comparison by log-expectation. In the
> + authors tests, MUSCLE achieved the highest scores of all tested
> + programs on several alignment accuracy benchmarks, and is also one of
> + the fastest programs out there.
> +</project>
> +
> +
> <project name="NJplot"
> url="http://pbil.univ-lyon1.fr/software/njplot.html";
> license="<free />"
> @@ -649,6 +661,17 @@
> </project>
>
>
> +<project name="TreeView X"
> + url="http://darwin.zoology.gla.ac.uk/~rpage/treeviewx/";
> + license="GPL"
> + deb="http://mentors.debian.net/debian/pool/main/t/treeviewx/";>
> + TreeView X is a program to display phylogenetic trees on Linux and Unix
> + platforms. It can read and display NEXUS and Newick format tree files
> + (such as those output by PAUP*, ClustalX, TREE-PUZZLE, and other
> + programs).
> +</project>
> +
> +
> ######################################################################
> ## Not available as a Debian package
> ######################################################################
> @@ -678,6 +701,18 @@
> </project>
>
>
> +<project name="Dialign"
> + url="http://dialign.gobics.de/";
> + licence="LGPL">
> + DIALIGN2 is a command line tool to perform multiple alignment of
> + protein or DNA sequences. It constructs alignments from gapfree pairs
> + of similar segments of the sequences. This scoring scheme for
> + alignments is the basic difference between DIALIGN and other global or
> + local alignment methods. Note that DIALIGN does not employ any kind of
> + gap penalty.
> +</project>
> +
> +
> <project name="Genographer"
> url="http://hordeum.oscs.montana.edu/genographer/";
> license="GPL">
> @@ -720,14 +755,4 @@
> whose sequences can be different. TM-align will first find the best
> equivalent residues of two proteins based on the structure similarity
> and then output a TM-score.
> -</project>
> -
> -
> -<project name="TreeView"
> - url="http://darwin.zoology.gla.ac.uk/~rpage/treeviewx/";
> - license="GPL">
> - TreeView X is a program to display phylogenetic trees on Linux and Unix
> - platforms. It can read and display NEXUS and Newick format tree files
> - (such as those output by PAUP*, ClustalX, TREE-PUZZLE, and other
> - programs).
> </project>
--- microbio.wml_old 2006-04-12 00:47:29.000000000 +0900
+++ microbio.wml 2006-04-13 09:16:23.000000000 +0900
@@ -1,6 +1,6 @@
<define-tag pagetitle>Debian-Med : Biologie mol�laire et g�tique</define-tag>
-#use wml::debian::translation-check translation="1.58" maintainer="Charles Plessy"
+#use wml::debian::translation-check translation="1.59" maintainer="Charles Plessy"
#use wml::debian::debian-cdd CDD="Debian-Med"
#$Id: microbio.wml,v 1.7 2006/03/27 20:55:43 toddy Exp $
@@ -305,6 +305,17 @@
</ul>
</project>
+<project name="Muscle"
+ url="http://www.drive5.com/muscle/";
+ license="Public Domain"
+ deb="http://packages.debian.org/unstable/science/muscle";>
+ MUSCLE est un programme pour l'alignement multiple de s�ences prot�ues.
+ MUSCLE est un acronyme anglais signifiant � comparaison de s�ences
+ multiples par log-expectation �. Dans des tests mesurant la qualit�es
+ alignements et effectu�par ses auteurs, MUSCLE a obtenu les meilleurs notes
+ parmi tous les programmes compar� C'est aussi l'un des plus rapides.
+</project>
+
<project name="NJplot"
url="http://pbil.univ-lyon1.fr/software/njplot.html";
@@ -626,10 +637,11 @@
url="http://jmol.sourceforge.net/";
license="LGPL"
deb="http://debian.wgdd.de/debian/dists/unstable/contrib/binary-all/science/";>
- Jmol est un visualisateur de mol�les libre, pour les �diants, les enseignants
- et les chercheurs en chimie et biochimie. Il fonctionne sur plusieurs plates-formes,
- comme Windows, Max OS X et les syst�s Linux/Unix.
- <ul>
+ Jmol est une visonneuse de mol�les libre, pour les �diants, les
+ enseignants et les chercheurs en chimie et biochimie. Il fonctionne sur
+ plusieurs plates-formes, comme Windows, Max OS X et les syst�s
+ Linux/Unix.
+<ul>
<li>JmolApplet est une applet pour navigateur web qui peut �e
ins�e dans des pages web.</li>
<li>L'application Jmol est une application Java ind�ndante qui
@@ -643,7 +655,7 @@
url="http://jtreeview.sourceforge.net/";
license="GPL"
deb="http://bioinformatics.pzr.uni-rostock.de/~moeller/debian/treeview/";>
- Java TreeView est un visualisateur modulaire pour donn� au format PCL ou
+ Java TreeView est une visionneuse modulaire pour donn� au format PCL ou
CDT venant de puces �DN.
</project>
@@ -714,7 +726,15 @@
et la qualit�'impression de TeX, pour un investissement en temps raisonnable.
</project>
-
+<project name="TreeView X"
+ url="http://darwin.zoology.gla.ac.uk/~rpage/treeviewx/";
+ license="GPL"
+ deb="http://mentors.debian.net/debian/pool/main/t/treeviewx/";>
+ Treeview X est un programme pour afficher des arbres phylog�tiques sur
+ des plates-formes Linux et Unix. Il peut lire et afficher des arbres aux formats
+ NEXUS et Newick (typiquement produits par PAUP*, ClustalX, TREE-PUZZLE,
+ et d'autres programmes).
+</project>
######################################################################
## Not available as a Debian package
@@ -746,6 +766,16 @@
</p>
</project>
+<project name="Dialign"
+ url="http://dialign.gobics.de/";
+ licence="LGPL">
+ DIALIGN2 est un outil en ligne de commande pour effectuer des alignements
+ multiples de s�ences prot�ues ou nucl�idiques. Il construit les
+ alignements �artir de paires continues de segments similaires dans les
+ s�ences. Le syst� de notation des alignements est diff�nt entre DIALIGN
+ et les autres m�odes globales ou locales. Notez que DIALIGN n'utilise pas de
+ p�lit�d'insertion ou d'extension.
+</project>
<project name="Genographer"
url="http://hordeum.oscs.montana.edu/genographer/";
@@ -787,13 +817,3 @@
�ivalents dans les deux prot�es, d'apr�la similarit�e leurs
structures, puis ensuite produit un score � TM �.
</project>
-
-
-<project name="TreeView"
- url="http://darwin.zoology.gla.ac.uk/~rpage/treeviewx/";
- license="GPL">
- Treeview X est un programme pour afficher des arbres phylog�tiques sur
- des plates-formes Linux et Unix. Il peut lire et afficher des arbres aux formats
- NEXUS et Newick (typiquement produits par PAUP*, ClustalX, TREE-PUZZLE,
- et d'autres programmes).
-</project>
Reply to: