en esencia el SSD lo tratas como cualquier otro disco, la diferencia radica en su velocidad.
En su mayoría son discos pequeños, yo acostumbro poner el sistema operativo y la partición swap en ellos, eso mejora muchísimo la velocidad. la carpeta home la pongo en discos mecánicos.
Si tu sistema operativo no cabe, puedes meter allí var y tmp, eso también te dará un muy buen rendimiento.
Sobre las particiones, creo que depende más de la cantidad y tipo de archivos que vas a almacenar.