Hola a todos, la solucion al problema fue cambiar de sistema de ficheros, pasar de ntfs a vfat, eso es lo que he hecho y ha funcionado.
Por otro lado, pienso que talvez necesitaba instalar algun paquete relacionado con ntfs y que por eso solo veia el disco como de lectura y no le podia cambiar los permisos aun siendo root.
De todas formas , gracias por vuestra ayuda.