Compilar el kernel no es dificil, la única pega es que tarda mucho pero con un como de inglés y bastante paciencia (ya que hay un montón de opciones/módulos que se pueden cargar/eliminar) está chupado! xD
Aquí tienes una guía muy buena:
http://www.howtoforge.com/kernel_compilation_debian_etchSupongo que también servirá para Debian Lenny o Sid.
Si no sabes para que sirve cada módulo/opción usa la opción
Help para obtener más información (y alguna recomendación de vez en cuando)
Otra web para consultar las novedades y las configuraciones de los kernels es esta:
http://www.kernelnewbies.org/