Em geral isso tem mais a ver com o tipo de tráfego que será suportado. Se vc já conhece o padrão, pode sim fazer alguns tunnings.
Ano passado, no FISL, o André apresentou alguns tunnings pra performance em servidores Debian. Acho que está lá na comunidade debianbr do softwarelivre.org.
Pessoal existe algum padrao para Tuning a nivel de kernel, que pode ser usado por exemplo numa instalacao limpa, e que vai abrigar por exemplo apache e ou mysql?