Apache : problèmes de permissions

[Samy Mezani <samy.mezani@wanadoo.fr>]

Bonjour,

Je "gère" (de loin) un site web pour une petite asso auto-hébergé sur un 
serveur web Debian avec Apache, mis à jour récemment de jessie en wheezy.

J'ai fait la mise à jour il y a environ 1 mois via une connexion ssh. 
Tout s'est a priori bien passé mais, depuis, certains sites web ne 
répondent plus.

Spip (http://domain.tld/yyyy)
"Forbidden
You don't have permission to access /yyyy/ on this server."

Dokuwiki (http://domain.tld/dokuwiki)
aucun souci

ownCloud (http://domain.tld/owncloud)
aucun souci

phpMyAdmin (http://domain.tld/phpmyadmin)
aucun souci

phpPgAdmin (http://domain.tld/phppgadmin/";
"Forbidden
You don't have permission to access /phppgadmin/ on this server."

J'ai regardé les permissions des dossiers :

/var/lib/
drwxr-xr-x  8 root     root       4096 mars  16 22:16 spip
drwx------  6 www-data root       4096 juil. 26  2011 dokuwiki
drwxr-xr-x  6 root     root       4096 août  12  2014 owncloud
drwxr-xr-x  3 root     root       4096 mai   10  2013 phpmyadmin

Ça ne m'aide pas vraiment. Je ne sais pas par où attaquer le problème.

Si quelqu'un a une idée, merci.

Samy