я сталкивался с подобной проблемой, Вам нужно четко знать в какой кодировке у вас backup или dump, и как отображаются данные при коннекте через стандартный mysql-client. А вот как я решил свою проблему: http://broderix.blogspot.com/2006/11/mysql-5x.html надеюсь хоть как-то поможет.