Пожалуй, в первый раз я высказался слишком кратко. Полнее будет так.
Если есть возможность убрать опознавательные знаки средствами конфига,
можно этой возможностью воспользоваться. Можно не, сильно хуже не
будет. А вот пересобирать - не стоит. Либо ты при пересборке не
меняешь версию пакета, и после обновления он снова начинает
признаваться, либо, что хуже, ты меняешь версию пакета и имеешь шанс
прощелкать security update. Чем может воспользоваться червяк или хакер,
который не верит приветствию сервера.