Проблема с вероятностью 99% кроется в X.Org - скорее всего стоит версия 6.8.2 - на ней и появляются проблемы. Я это заметил еще в жденте, как только обновил Х-ы. Сейчас на юникодовой локали в debian unstable та же фигня. Но меня это не сильно напрягает, поскольку единственная gtk1-прога - это aMule - да и то в ее настройках можно включить английский язык интерфейса :)