Да, винда перенастроила карту на другие irq/ports. Рекомендую переткнуть карту в другой слот. В линуксе она скорее всего сможетзавестись, может будет работать и после загрузки в винду..
а нельзя линукс как-то заставить определить irq/ports карточки самому ? либо руками выставить ? kudzu это не сможет проделать ? (только щас на ум пришло...)