Gracias Arnau por las aclaraciones, ya me queda mas claro el tema, sobretodo con el ejemplo de gmail. bueno te cuento un poco como esta la estructura de la organizacion.
Actualmente hay dos servidores de correo aqui, uno para los administrativos y otro para los alumnos, los administrativos funcionan del como
usuario@ejemplo.com y los alumnos como
usuario@alumnos.ejemplo.com, entonces la idea es tener tanto a funcionarios como alumnos con el mismo dominio
usuario@ejemplo.com y
alumno@ejemplo.com, pero con dos servidores distintos, la idea de esto es basicamente por que la cantidad de alumnos es aproximadamente de 4000, ya tengo el dns configurado con los registros MX perfectamente y puedo enviar correos desde ambos servidores pero el tema es el recibir correo en los distintos usuarios.
Reitero mis agradecimientos al tiempo que se han tomado en responder.
Saludos