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gerar e aplicar diffs



Caros

Consertei um código de um programa e gostaria de gerar e aplicar um diff. 
Alguém poderia me ensinar a fazê-lo. Para gerar o diff dei o seguinte comando:

diff configure.in configure.in.by.beak > configure.in.diff

Mas o resultado foi diferente do que eu esperava , pois , esperava um arquivo 
com "+" e "-" e não com "<" ">" , e como eu faço para aplicar um diff.

O diffs são os que geram os patchs ?

Alguém poderia me dar uma luz ?

grato.



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