Das Problem ist, das es sogenannte Meta-Pakete gibt. Mit denen kann man recht einfach ganze Software-Suiten installieren, ohne manuell haufenweise Pakete einzeln auswählen zu müssen. Nachteil der Sache ist, wenn man einen Teil wieder entsorgen möchte, soll das Meta-Paket ebenfalls deinstalliert werden (und damit praktisch alles andere auch), der Abhängigkeiten wegen.
Das wird übrigens auch gerade auf debian-devel diskutiert: http://lists.debian.org/debian-devel/2012/07/msg00211.html