Es wird wohl das beste sein für diese Anwendung auch einen entsprechend ausgerüsteten DNS-Server zu verwenden. Es sind ja einige LDAP- bzw. SQL-basierte DNS-Server im Umlauf und dort dürftest Du wohl am besten aufgehoben sein. Einen plain-file basierten DNS-Server wie den unmodifizierten BIND9 würde ich in diesem Umfeld als ungeeignet betrachten.