Bernhard Kleine <bbfk@gmx.net> (Fr 02 Mai 2008 20:47:30 CEST): > Hallo, > > ich habe in einer Datei GnRHs.fasta 185 Einträge folgender Form: > > >gi|254825|gb|AAB63599.1| gonadotrophin-releasing hormone; > MDLSSKTVVQVVMLALIAQVTFSQHWSYGWLPGGKRSVGELEATIRMMDTGGVMALPEETGAHIPERLRP > YDVMSKKRMPHK Verstehe ich das korrekt: Es sind zweizeilige Einträge (oder sogar dreizeilig? Ich bin mir nicht sicher, wo Dein Editor und wo mein Mailclient umbrechen. > in einer zweiten Datei names.txt sind 185 Einträge wie z.B.: > GnRH-1 Oncorhynchus masou |cherry salmon|fish| gi|254825|gb|AAB63599.1| Das sind dann also einzeilige Einträge? Und das "gi|254825|gb|AAB63599.1|" kommt genau so sin beiden Files vor und ist eindeutig? Gehören die ">" in Deiner Mail zu den Files? Also geht im ersten File ein neuer Eintrag immer mit ">" los? > Ich möchte jetzt in GnRHs.fasta jeweils die erste Zeile durch den Namen > des entsprechenden Tieres > >GnRH-1 Oncorhynchus masou |cherry salmon|fish| > > Zweitens möchte ich die entstehende neue Datei nach dem zweiten plus > dritten Wort der neuen ersten Zeile sortieren. > > Das schaffe ich nicht alleine und benötige Eure Hilfe. Ich kann das auch > von Hand machen, brauch aber ein Paar Stunden. Nun, es ist die Frage, wie oft das am Ende stattfinden muß. -- Heiko
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