Bonjour Pierre, (je ne connaissais même pas xdotool)au jugé, comme ça, peut-être des paramètres claviers (et autres paramètres internationaux) dans ta configuration Xorg différents de ceux de ton environnement Bash?
https://wiki.debian.org/Xorg#Configure_X pour le clavier: # dpkg-reconfigure keyboard-configuration mais bon, c'est peut-être totalement autre chose