Цитата из академического латинско-русского словаря Дворецкого:
repositorium ... 1) репозиторий, высокий ящик из поставленных друг на друга подносов (fercula) для различных блюд (род судков или поставца) ...; блюдо ...
2) гробница
Да, эта разница ещё из латинского тянется. Есть слова на -arium, есть на -orium. На -orium в общем и целом - что-то неживое или заведение.