Su virtualbox ho una debian Lenny con una procedura di backup con cron.
C'è questo semplice comando
genisoimage -R -J -l -o $IMG -exclude-list $LISTAESCLUSIONE $PATHSOURCE
Sta di fatto che copia un castigo di directory su questo file iso, ma una directory che ho in orginale (non link) in due percorsi diversi me la salta entrambe le volte.