Ho poca panoramica sui differenti demoni fpt che ci sono in giro, però tempo addietro ho provato ad usare Proftpd e mi son trovato bene.
La configurazone può esser scritta su mysql [1] e le dir dove va a scrivere possono coincidere con quelle dove apache va a leggere.
[1]
http://www.debuntu.org/how-to-ftp-virtual-host-with-proftpd-mysqlCiao